Study of Stability and Reactivity of Cyclopolic Acid Compounds and Their Derivatives Using Semi-empirical Methods AM1 and PM3

Penulis

  • Arsyad Arsyad Universitas Khairun Ternate
  • Haniran Majid Universitas Khairun Ternate
  • Topan Setiawan Universitas Khairun Ternate
  • Muhammad Adrian Natsir Universitas Khairun Ternate

DOI:

https://doi.org/10.33387/tjp.v10i2.2949

Kata Kunci:

semiempirical methods, cyclopolic acid, stability, reactivity

Abstrak

The semiempirical method is a method that can be selected in computational chemistry. This method can be used to study the stability and reactivity of cyclopolic acid compounds and their derivatives. This method is simple method in optimizing a compound in calculating the parameters possessed by the atom. Cyclopolic acid is an organic compound that can be found in corn and beans. Analysis using two methods on HyperChem Professional application are AM1 and PM3. Analysis Result shows that the total energy and gradient of each compound do not have significant differences in calculations. As in the structure of 2-formyl-3-(hydroxymethyl)-6-methoxy-5-methylterephthalic acid has a total energy of -80608.1868567 (kcal/mol) and a gradient of 0.0898817 (kcal/mol/Ang) with the AM1 method and total energy of -74935.9180118 (kcal/mol) and a gradient of 0.0874369 (kcal/mol/Ang) with the PM3 method. The stable structure is in the structure of the 2-formyl-3-(hydroxymethyl)-6-methoxy-5-methylterephthalic acid based on the calculation of the total energy and gradient. Meanwhile, according to the calculation of the difference between LUMO-HOMO, it has different results. Where according to the calculation of the energy difference between LUMO-HOMO, the most stable compound structure is the structure of 2-formyl-3-(hydroxymethyl)-4-isocyano-6-metoxy-5-methylbenzoic acid but is not reactive. Likewise, the 2-formyl-4-hidroxy-3-(hydroxymethyl)-6-methoxy-5-methylbenzoic acid, 2-formyl-3-(hydroxymethyl)-6-methoxy-5-methyl-4-(oxo-λ6-methyl)benzoic acid and 2-formyl-3-(hydroxymethyl)-6-methoxy-5-methylterephthalic acid are reactive but unstable compound structure.

Unduhan

Data unduhan belum tersedia.

Referensi

Asmara, A. P., Mudasir, M., & Siswanta, D. (2015). Penentuan Metode Komputasi untuk Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas Senyawa Turunan Triazolopiperazin Amida. Elkawnie: Journal of Islamic Science and Technology, 1(1), 19-30. http://dx.doi.org/10.22373/ekw.v1i1.515

Azizah, R. N., Alam, G., Rifai, Y., & Lethe, C. (2013). Aplikasi Komputasi Kimia dalam Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (HKSA) dari Senyawa Aktif Antibakteri Analog N-Alkil Imidazol pada Bakteri (Staphilococcus aureus) Dengan Parameter Elektronikmetode Austin Model (AM 1). Jurnal Ilmiah As-Syifaa, 5(1), 1-11. https://doi.org/10.33096/jifa.v5i1.63

Birkinshaw, J. H., Raistrick, H., Ross, D. J., & Stickings, C. E. (1952). Studies in the biochemistry of micro-organisms. 85. Cyclopolic and cyclopaldic acids, metabolic products of Penicillium cyclopium Westling. Biochemical Journal, 50(5), 610-628. https://doi.org/10.1042/bj0500610

Chandra, A. F., & Siallagan, J.(2020). Kajian Reaktifitas Stabilitas Senyawa Miristin dan Turunannya dengan Menggunakan Metode Fungsional Kerapatan. Avogadro Jurnal Kimia, 4(1), 24-30. http://dx.doi.org/10.31957/.v4i1.1169

Dewi, N. S., & Sanjaya, I. G. (2018). Computational Study of Mangiferin Compound and Its Derivate as an Antidiabetic Type I Using QSAR Method and Molecular Docking. UNESA Journal of Chemistry, 7(1), 8-14.

Dhuha, N. S., Aswad, M., & Haeria, H. (2014). Aplikasi Kimia Komputasi dalam Hubungan Struktur Aktivitas Senyawa Analog Turunan Quinolin dari Cinchona Ledgeriana Moens Sebagai Antimalaria. Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar, 2(2), 46-55. https://doi.org/10.24252/jurfar.v2i2.2199

Duncanson, L., Grove, J. F., & Zealley, J. (1953). 733. Gladiolic Acid. Part III. The Structures of Norisogladiolic Acid, Dihidrogladiolic Acid and Cyclopolic Acid. J. Chem. Soc, 54(0), 3637-3645.

Haeria, N. S. (2014). Aplikasi Kimia Komputasi dalam Struktur Aktivitas Antioksidan Senyawa Analog Kalkon. Jurnal FIK UNIMA, 2(2), 46-58.

Ivansyah, A. L. (2020). Investigasi Teoretis Interaksi Nonkovalen antara β-Siklodekstrin dan Hidroksiklorokuin. Akta Kimia Indonesia, 5(2), 127-140. http://dx.doi.org/10.12962/j25493736.v5i2.7962

Johnson.S, C. F. (2020). Kajian Reaktivitas Stabilitas Struktur Senyawa Miristin dan Turunannya dengan Menggunakan Metode Fungsional Kerapatan. Jurnal Kimia, 1(4), 24-30.

Lipkowitz, K. B., & Boyd, D. B. (1990). Reviews in Computational Chemistry. New York: John Wiley & Sons, Inc.

Muchtaridi, M., Mutalib, A., Jutti, L., Diantini, A., & Musfiroh, I. (2011). Prediksi Aktivitas Antikanker Payudara Senyawa Fevicordin dari Biji Phaleria Macrocarpa (Scheff) Boerl. pada ERĄ melalui Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas Metode Multiple Linear Regression Analysis dan Partial Component Analysis. Bionatura-Jurnal Ilmu-ilmu Hayati dan Fisik, 13(1). 40-46.

Oliveira, A. F., Seifert, G., Heine, T., & Duarte, H. A. (2009). Density-functional based tight-binding: an approximate DFT method. Journal of the Brazilian Chemical Society, 20, 1193-1205. https://doi.org/10.1590/S0103-50532009000700002

Paramita, S., Permata S., M., Vaulina Y.D., E., Nasrokhah, & Iswanto, P. (2020). Pemilihan Metode Perhitungan Kimia Komputasi Semi-empiris untuk Pengembangan 1,3,4-Thiadiazole. Indonesian Journal of Chemical Research, 8(1), 51-56. https://doi.org/10.30598/10.30598//ijcr.2020.8-pon

Rendrahadi, R. D., Tjahjanto, R. T., & Utomo, E. P. (2014). Kajian Teoritis Interaksi TiO2-Zeolit Menggunakan Metode Semiempiris MNDO, AM1, dan PM3. Jurnal Ilmu Kimia Universitas Brawijaya, 1(1), 43-49.

Roncal, T., Cordobés, S., Sterner, O., & Ugalde, U. (2002). Conidiation in Penicillium cyclopium IS Induced by Conidiogenone, an Endogennous Diterpene. Eukaryotic cell, 1(5), 823-829. https://doi.org/10.1128/EC.1.5.823-829.2002

Saputra, A., Wijaya, K., Ahmad, M. N., & Tahir, I. (2013). Penggunaan Metode Semiempirik AM1 untuk Pemilihan Monomer Fungsional Efektif pada Prasintesis Polimer Tercetak Diazinon. Jurnal Kimia Valensi, 3(1), 1-9. https://doi.org/10.15408/jkv.v3i1.323

Setiadji, S., Ivansyah, A. L., & Pribadi, A. B. (2015). Studi Komputasi Senyawa Berbasis Anisil Indol dengan Senyawa Akseptor Asam Sianoakrilik sebagai Sensitizer Solar Sel Organik. al-Kimiya: Jurnal Ilmu Kimia dan Terapan, 2(1), 41-45. https://doi.org/10.15575/ak.v2i1.351

Tuslinah, L., & Indra. (2013). Uji Reaktivitas Antioksidan Senyawa s-allyl cysteine dan s-allyl-mercapto-l-ctsteine dengan Menggunakan Kimia Komputasi PM3. Jurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada, 9(1), 36-41. http://dx.doi.org/10.36465/jkbth.v9i1.92

Unduhan

File Tambahan

Diterbitkan

2021-10-30

Terbitan

Vol 10 No 2 (2021): Techno Jurnal Penelitian

Bagian

Artikel

Lisensi

Syarat yang harus dipenuhi oleh Penulis sebagai berikut:

  1. Penulis menyimpan hak cipta dan memberikan jurnal hak penerbitan pertama naskah secara simultan dengan lisensi di bawah Creative Commons Attribution License yang mengizinkan orang lain untuk berbagi pekerjaan dengan sebuah pernyataan kepenulisan pekerjaan dan penerbitan awal di jurnal ini.
  2. Penulis bisa memasukkan ke dalam penyusunan kontraktual tambahan terpisah untuk distribusi non ekslusif versi kaya terbitan jurnal (contoh: mempostingnya ke repositori institusional atau menerbitkannya dalam sebuah buku), dengan pengakuan penerbitan awalnya di jurnal ini.
  3. Penulis diizinkan dan didorong untuk mem-posting karya mereka online (contoh: di repositori institusional atau di website mereka) sebelum dan selama proses penyerahan, karena dapat mengarahkan ke pertukaran produktif, seperti halnya sitiran yang lebih awal dan lebih hebat dari karya yang diterbitkan.