Analisis Hubungan Kuantitatif Antara Struktur Dengan Aktivitas Antimikroba Streptococcus mutans Penyebab Sakit Gigi Menggunakan Senyawa Turunan Eugenol

Ike Dwi Setiani, Muliadi -, Nur Asbirayani Limatahu

Sari


Abstrak

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pemodelan struktur senyawa turunan eugenol menggunakan metode HKSA (Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas) dan untuk mengetahui aktivitas antimikroba senyawa turunan eugenol pada bakteri Streptococcus mutans. Pemodelan struktur molekul telah dilakukan secara komputasi dengan menggunakan software ChemDraw Ultra 12.0. Hasil optimasi  menggunakan metode semi empiris AM1 menghasilkan energi total dan panas pembentukan dari masing-masing senyawa turunan eugenol. Perhitungan hubungan antara deskriptor (elektronik, hidrofobik, dan sterik) dengan aktivitas antimikroba dilakukan dengan menggunakan analisis korelasi yang terdapat dalam program IBM SPSS 25. Hasil analisis menunjukkan terdapat adanya hubungan antara deskriptor dengan antivitas antimikroba (Log P) yaitu EHOMO, ELUMO, Gap, MD, Polarizability, PSA, MSA, Idenks Harary, Indeks Randic, Indeks Weiner, qC1, qC2, qC3, qC6, qC7, dan qC8. Penentuan model persamaan HKSA terbaik dilakukan dengan menganalisis regresi linear berganda menggunakan paket program IBM SPSS 25. Hasil analisis yang didapatkan untuk model persamaan HKSA terbaik terdapat pada persamaan model 1 : Log P = 0.149 - (11.299) qC8 – (9.190) qC2 + (0.163) Polarizability – (6.720) ELUMO – (0.783) MD dengan n = 7, R = 0.999, R2 = 0.998, SE = 0.07399.

 Kata Kunci :       

Eugenol, Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas, Austin Model-1, Antimikroba, Streptococcus mutans

 

Abstract

 

This study aims to determine the structural modeling of eugenol derivative compounds using the QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) method and to determine the antimicrobial activity of eugenol derivative compounds in Streptococcus mutans bacteria. Molecular structure model have been done with computationally using ChemDraw Ultra 12.0 software. The optimization results using the AM1 semi-empirical method produce the total energy and ordered heat of each eugenol derivative. The calculation of the relationship between descriptors (electronic, hydrophobic, and steric) with antimicrobial activity was performed using correlation analysis contained at IBM SPSS 25 program. The results of correlation analysis there was showed relationship between descriptors with antimicrobial activity (Log P) such as: EHOMO, ELUMO, Gap, MD, Polarizability, PSA, MSA, Harary's Idenks, Randic Index, Weiner Index, qC1, qC2, qC3, qC6, qC7, and qC8. Determination the best model of QSAR equation of performed by analyzing multiple linear regression using IBM SPSS 25 program package. The results of analysis multiple linear regression obtained for the best QSAR equation model found in model 1 equation. Log P = 0.149 - (11.299) qC8 – (9.190) qC2 + (0.163) Polarizability – (6.720) ELUMO – (0.783) MD with n = 7, R = 0.999, R2 = 0.998, SE = 0.07399.

Keywords:

Eugenol, Quantitative Structure Activity Relationship, Austin Model-1, Antimicrobial, Streptococcus mutans


Teks Lengkap:

PDF

Referensi


Andries, J. R., Gunawan, P. N., & Supit, A. (2014). uji efek anti bakteri ekstrak bunga cengkeh terhadap bakteri Streptococcus mutans secara in vitro. e-GiGi, 2(2).

Armunanto, R & Sudiono, S. (2004). Relation Of Electronic Structures With Their Antimalaria Activities On Artemisinin Derivatives, Indonesia Journal of Chemistry, vol. 4, no. 3, hh. 121-127.

Da Silva, F. F. M., Monte, F. J. Q., de Lemos, T. L. G., Do Nascimento, P. G. G., de Medeiros Costa, A. K., & De Paiva, L. M. M. (2018). Eugenol derivatives: synthesis, characterization, and evaluation of antibacterial and antioxidant activities. Chemistry Central Journal, 12(1), 1-9.

Dwandaru, W. B., Putri, Z. C., & Yulianti, E. (2016). Pengaruh Variasi Konsentrasi Bahan Aditif Larutan Nanopartikel Perak Terhadap Sifat Anti-Jamur Cat Dinding sebagai Aplikasi Teknologi Nano dalam Industri Cat Dinding. INOTEKS, 20(1), 1-18.

Hasanuddin, A.P., & Salnus, S. (2020). Uji Bioaktivitas Minyak Cengkeh (Syzygium aromaticum) Terhadap Pertumbuhan Bakteri Streptococcus mutans Penyebab Karier Gigi. BIOMA: Jurnal Biologi Makasar, 5(2), 241-250.

Itte, P. Amshumali, M. K. & Pasha, M. (2017). Molecular modeling, geometry optimization and characterization of bimetallic complexes derived from s-indacene, Universal Journal of Chemistry, vol. 5, no. 3, hh. 48-57

Karim, Hasbul B. (2019). Kajian Senyawa Turunan Benzopirazin sebagai Antimalaria Menggunakan Metode Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas dan Regresi Multilinear. Universitas Khairun, Ternate

Mervrayano, J., Rahmatini, R., & Bahar, E. (2015). Perbandingan Efektivitas Obat Kumur yang Mengandung Chlorhexidine dengan Povidone Iodine terhadap Streptococcus. Jurnal Kesehatan Andalas, 4(1), 169

Nejad, S. M., Ozgunes, H., & Basaran, N. (2017). Pharmacological and toxicological properties of eugenol. Turkish Journal of Pharmaceutical Sciences, 14(2), 201.

Rakhman, K. A., Jayali, A. M., Abdjan, M. I., Ahmad, A. U. & Putra, C. A.R. (2018), 1.10-Phenanthroline as anti-radiation uv agent: spectrophotometry analysis and modeling, Global Journal of Science Frontier Research: B Chemistry, vol. 18, no. 3, hh. 25-29.

Supomo, F. D. S. (2017). Pengaruh Ekstrak Daun Sirih Merah (Piper cf. fragile Benth.) Terhadap Bakteri Penyebab Sakit gigi. Ekologia: Jurnal Ilmiah Ilmu Dasar dan Lingkungan Hidup, 11(1), 30-35.

Tulungen, F. R. (2019). Cengkeh Dan Manfaatnya Bagi Kesehatan Manusia Melalui Pendekatan Competitiv Intelligence. Biofarmasetikal Tropis, 2(2), 15.




DOI: https://doi.org/10.33387/jpku.v1i2.5096

Refbacks

  • Saat ini tidak ada refbacks.


EDITORIAL OFFICE:

Program Studi Pendidikan Kimia

Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

Universitas Khairun

Jl. Bandara Sultan Baabullah, Kelurahan Akehuda Kec. Kota Ternate Utara, 97728

 

 Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.