Jurnal Bioedukasi dikelola dan diterbitkan oleh Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP Universitas Khairun. Jurnal ini pertama kali terbit (versi cetak) pada September tahun 2012. Sejak awal diusulkan p-ISSN, Jurnal ini telah diterbitkan sebanyak 2 kali dalam setahun, yakni Edisi Maret dan September. Sempat aktif terbit hingga 2016 (Pernah terdaftar di Portal Garuda), dan kemudian mengalami mandeg kurang lebih selama 6 tahun. Pergantian pimpinan redaksi, mewarnai perjalanan jurnal ini. Hingga pada tahun 2022, atas inisiasi dari Bapak Suparman, M.Si., Ph.D mulai menata kembali dan mengajukan e-ISSN ke Badan Riset Inovasi Nasional (BRIN), dan terdaftar dengan e-ISSN 2829-0844 berdasar SK: 0005.28290844/K.4/SK.ISSN/2022.04. Pada saat pengajuan e-ISSN ke BRIN, atas dasar saran dan masukan dari tim e-ISSN, agar frekuensi terbitan disesuaikan menjadi April dan Oktober.
Dengan semangat dan Komitmen yang tinggi, dan didukung oleh Sumber daya manusia yang saat ini memiliki jejaring dengan Relawan Jurnal Indonesia (RJI) berharap dapat memberikan kontribusi bagi peningkatan ilmu pengetahuan di negeri Moloku Kieraha (Provinsi Maluku Utara), nasional maupun internasional melalui pengelolaan Jurnal yang berkualitas.